小智道：“我也很想看看你的宝可梦们的实力，喷火龙、皮卡丘拜托你们了！喷火龙，超级进化！”
小智的喷火龙一登场就是气势全开，一道光芒后喷火龙超级进化成了喷火龙X，作为小智最初收服的宝可梦之一，喷火龙的实力在神兽级之下除了皮卡丘外毫无对手！
喷火龙与皮卡丘一同冲了上去，皮卡丘一发十万伏特配合喷射火焰，迅速将火炎狮给**，速度之快弗拉达利都还没有反应过来，火炎狮就已经失去了战斗能力。
喷火龙紧接着与皮卡丘前后夹击打雷和破环光线同时使用，不到一分钟的时间就弗拉达利的火炎狮和暴鲤龙就已经都失去了战斗能力！
弗拉达利对这个结果也没有多意外，这时幻彩水晶塔中一道红色的光线准确的照射到了与Z2缠斗的小软身上，小软的身体开始变红，并发出了痛苦的呻吟声。
柚丽嘉他们此时正准备进入幻彩水晶塔，柚丽嘉看到小软这样就想要去救它，小软已经失去了神智，听到柚丽嘉叫它，它便转过了身，黑色藤蔓朝着柚丽嘉的方向攻来，利莫内大叔及时出现，火焰鸡和拉帝亚斯挡在了柚丽嘉的面前，利莫内将柚丽嘉护在身后，问道：“小姑娘，你没事吧！”
柚丽嘉道：“我没事，只是小软它......”
利莫内大叔道：“你们看，天空中有帝牙路卡和帕鲁齐亚，小智搜查官是不会让基格尔德出事的。”
柚丽嘉点了点头，她相信小智哥哥一定可以救回小软的，现在当务之急是要抢回幻彩水晶塔的控制权。柚丽嘉跟上了小刚他们的脚步进入了幻彩水晶塔！
不良蛙和蜥蜴王等宝可梦进行开路，希特隆来到了控制室外，在面板上输入了密码却没有开启控制室的门，希特隆道：“果然密码已经被闪焰队改了！”
“这个时候就要看我的了！主人！”希特洛伊特一直都在道馆里。
希特隆道：“交给你希特洛伊特！”希特洛伊特虽然是希特隆制造的道馆代理机器人，但是同时也兼具道馆临时钥匙的工作，以便不时之需，现在刚好可以派上用场。
希特洛伊特的手伸出，放在了钥匙孔上，一扭动控制室的大门就开了。
控制室内闪焰队的研究员们，纷纷朝着门口的希特隆等人投来目光，有人已经喊道：“你们是什么人？”
希特隆走上前，道：“密阿雷道馆的道馆训练家，希特隆！”
库瑟洛斯奇道：“哦，你就是那个天才科学家密阿雷道馆的道馆训练家啊！很高兴能见到你！你的发明现在都已经被我改造完了，怎么样这可是我的得意之作！”
希特隆怒道：“给大家带来不幸的才不是发明！伦琴猫上吧！”
众人宝可梦全都已经就位，控制室内就只有库瑟洛斯奇以及两个研究人员而已，希特隆他们也没有花多大的力气就将三人完全控制并用绳子绑了起来。希特隆和希特洛伊特便立刻开始更改程序，在没有人注意到的时候柚丽嘉带着拉帝亚斯去找了小软。
希特隆利用了希特洛伊特的程序和控制室的程序连接，用希特洛伊特的系统进行更改，幸好库瑟洛斯奇的时间不够，没有将系统彻底锁定，更改起来虽然要费些时间，但是问题不大。
柚丽嘉与小软的感情最好，现在幻彩水晶塔的危机已经解除，哥哥他们已经在更改程序了，那么她也要尽自己的全力，小智哥哥只有一个人在解决前是暂时腾不出手来救小软的，那就由她去唤醒小软吧！
柚丽嘉在拉帝亚斯的帮助下来到了正在破坏的小软面前，大喊道：“小软你还记得我吗？我是柚丽嘉，和你一起玩耍的柚丽嘉！”
小软身前升起藤蔓朝着柚丽嘉打去，拉帝亚斯用龙之波动挡下了攻击。
此时的柚丽嘉没有了之前的慌张，她深吸了一口气，道：“小软，这首歌你应该还记得吧！是我为你创作的小软之歌，我经常唱给你听的！”
柚丽嘉唱了起来，小软此时的攻击弱了下来，显然它想起了一些事。柚丽嘉的歌声让小软回想起了她们在一起旅行、玩耍打闹的样子，渐渐的小软身上的红色逐渐褪去。
小软将头靠近了柚丽嘉，柚丽嘉抱住了小软，泪水滴落，道：“小软你终于想起我了！”
随着小软恢复神智，Z2也恢复了，它们原本就是一体的。细胞四散后，小软和Z2都恢复了核心状态。
小软跳到柚丽嘉的怀抱中，柚丽嘉蹲下身，朝着Z2打招呼道：“上次我们见过一面了，你就是小软的朋友吧！我是柚丽嘉，我们做朋友吧！”
Z2警觉的往后退，道：“你为什么还要相信人类！这些都是因为人类才让我们都失去了控制。”
小软道：“我还是相信人类，她们到现在也没有放弃希望！小智还在为了这个世界而努力着！”
Z2看向了幻彩水晶塔的方向，柚丽嘉笑道：“你要是不相信的话，就跟我们一起去看看吧！一起走，好吗？”
Z2看在小软的份上，勉强答应了。
帕琦拉此时也来到了幻彩水晶塔的顶端，道：“弗拉达利，你已经输了！”
弗拉达利看到帕琦拉站在了小智他们这边，吼道：“帕琦拉，你这是什么意思！”
帕琦拉道：“就如你所见，我是卡洛斯地区的火系天王，你要毁灭卡洛斯我就要阻止你！什么为了世界的和平所以就要破坏，我从来都不认可！要是早知道你制造超进化系统是为了毁灭卡洛斯地区，我说什么都不会帮你！你已经忘记了你的初心，野心已经占据了你的全部！”
弗拉达利道：“帕琦拉你太天真了，要是我失败的话，作为曾经帮助过我的你也难逃罪责！”
帕琦拉道：“我知道，但我不会逃避，比起不愿意面对现实的你，我想我比起你还算幸运！”
弗拉达利狰狞道：“你们根本不懂！我看过世界丑陋的一面，以前我曾带着大家去帮助过贫困的人们，美好的只是一开始，他们逐渐将帮助视作理所当然，到最后只会一味的提出要求，然后开始高声主张自己的权力！”
“愚蠢的人类！这个名为世界的系统，我要破坏掉，再进行修正！”
小智道：“我不可否认这就是人性，但是弗拉达利你有没有想过，就算你建立了一个新世界，覆灭了这些丑陋，这些丑陋就不会再次诞生了吗？只要世界上有人类，无论覆灭多少遍都会再次诞生，这样做还有意义吗？”
弗拉达利依旧执迷不悟道：“这些事在我的有生之年是不可能发生，我也不会看到！人类确实愚蠢，我也是一样的，为了这点可能性，我不可能放弃我的野心！”
说完弗拉达利纵身往后一跳，就消失在了众人的视线中。
小智的手机这时候响起，小霞的声音从另一端传来，急切道：“小智，弗拉达利研究所这边出事了！你快过来！”
帕琦拉道：“小智搜查官，你们先过去吧！弗拉达利交给我了，我应该知道他要去哪里！”说完帕琦拉就带着黑鲁加追了过去。
艾岚跟上了小智的脚步，事情的起因跟他有关，他没有办法不去管，两人便通过了胡帕的光环来到了弗拉达利研究所的外围。